Kędziorek trenerską karierę na poziomie seniorskim zaczął od pracy w klubach z niższych lig, kolejno sprawdzając się w Mazurze Karczew, Wildze Garwolin, PKS Radość, Starcie Otwock i Victorii Sulejówek. W ostatnich latach największe sukcesy osiągał jednak jako asystent.
W 2016 roku został asystentem Marka Papszuna w Rakowie Częstochowa, był więc częścią procesu niezwykle dynamicznego rozwoju Medalików, przechodząc z nimi drogę od II ligi do Ekstraklasy. Pod koniec 2019 roku rozstał się z Rakowem, a jego kolejnym miejscem pracy została Arka Gdynia. Przez nieco ponad rok miał tam okazję współpracować z Dariuszem Marcem i Ireneuszem Mamrotem, osiągając w tym czasie finał Fortuna Pucharu Polski w roku 2021.
Najbardziej owocny czas spędził jednak w Lechu Poznań. W stolicy Wielkopolski najpierw pomagał Maciejowi Skorży w trakcie sezonu, w którym Kolejorz sięgnął po krajowy tytuł, a następnie już z Johnem van den Bromem był częścią pięknej przygody Lecha w Lidze Konferencji. Kędziorek opuścił Poznań z końcem listopada minionego roku, by momentalnie skorzystać z nadarzającej się okazji, jaką była oferta z Radomiaka, gdzie stał się pierwszym trenerem.
Jak na razie jego wejście w ekstraklasowy świat jest całkiem udane, bo zespół pod jego wodzą jeszcze nie przegrał. W grudniu Kędziorek zdążył poprowadzić Radomiaka w 3 meczach, zaczynając od efektownego zwycięstwa 3:0 w Łodzi z Widzewem, by następnie zaliczyć dwa domowe remisy – z Górnikiem Zabrze i starymi znajomymi z Kolejorza. W pełni jego rękę prawdopodobnie zobaczymy jednak właśnie w nadchodzącej rundzie wiosennej, po tym, jak miał okazję przeprowadzić z nowym zespołem zimowy okres przygotowawczy w stu procentach według swojej wizji.
Maciej Kędziorek vs Cracovia
Jako asystent trenera Rakowa Częstochowa:
3.08.2019 Raków 1:3 Cracovia (PKO Ekstraklasa)
5.12.2019 Cracovia 0:0 Raków, 4:1 po r.k. (1/4 finału Fortuna Pucharu Polski)
8.12.2019 Cracovia 3:0 Raków (PKO Ekstraklasa)
Jako asystent trenera Lecha Poznań:
6.08.2021 Lech Poznań 2:0 Cracovia (PKO Ekstraklasa)
6.02.2022 Cracovia 3:3 Lech Poznań (PKO Ekstraklasa)
23.10.2022 Cracovia 0:0 Lech Poznań (PKO Ekstraklasa)
6.05.2023 Lech Poznań 3:0 Cracovia (PKO Ekstraklasa)
28.10.2023 Cracovia 1:1 Lech Poznań (PKO Ekstraklasa)